1944, dans un camp de concen­tra­tion. Séparé par la force de ses parents, le jeune Erik Magnus Lehn­sherr se découvre d’étranges pouvoirs sous le coup de la colère : il peut contrô­ler les métaux. C’est un mutant. Soixante ans plus tard, l’exis­tence des mutants est recon­nue mais provoque toujours un vif émoi au sein de la popu­la­tion. Puis­sant télé­pathe, le profes­seur Charles Xavier dirige une école desti­née à recueillir ces êtres diffé­rents, souvent reje­tés par les humains, et accueille un nouveau venu soli­taire au passé mysté­rieux : Logan, alias Wolve­rine. En compa­gnie de Cyclope, Tornade et Jean Grey, les deux hommes forment les X-Men et vont affron­ter les sombres mutants ralliés à la cause de Erik Lehn­sherr / Magnéto, en guerre contre l’hu­ma­nité.